XA事务支持限于InnoDB存储引擎。
MySQL XA实施是针对外部XA的，其中，MySQL服务器作为资源管理器，而客户端程序作为事务管理器。未实施“内部XA”。这样，就允许MySQL服务器内的单独存储引擎作为RM（资源管理器），而服务器本身作为TM（事务管理器）。处理包含1个以上存储引擎的XA事务时，需要内部XA。内部XA的实施是不完整的，这是因为，它要求存储引擎在表处理程序层面上支持两阶段提交，目前仅对InnoDB实现了该特性。
对于XA START，不支持JOIN和RESUME子句。
对于XA END，不支持SUSPEND [FOR MIGRATE]子句。
在全局事务内，对于每个XA事务，xid值的bqual部分应是不同的，该要求是对当前MySQL XA实施的限制。它不是XA规范的组成部分。
如果XA事务达到PREPARED状态而且MySQL服务器宕机，当服务器重启后，能够继续处理事务。就像原本应当的那样。但是，如果客户端连接中止而服务器继续运行，服务器将回滚任何未完成的XA事务，即使该事务已达到PREPARED状态也同样。它应能提交或回滚PREPARED XA事务，但在不更改二进制日志机制的情况下不能这样。