为了避免不必要的资源分配，默认情况下，在服务器的配置中将禁止NDB存储引擎。要想启用NDB，需要更改服务器的my.cnf配置文件，或使用“—ndbcluster”选项启动服务器。
由于MySQL服务器是簇的一部分，它也需要知道如何访问MGM节点，以便获得簇配置数据。默认行为是查找本地主机上MGM节点。但是，如果需要另外指定它的位置，可在my.cnf文件或MySQL服务器命令行上进行。能够使用NDB存储引擎之前，至少应有一个MGM节点是可操作的，而且还应有所需的数据节点。