对于任何能够与mysqld服务器端口监督程序一起给定的选项，也可以与嵌入式服务器库一起使用。在数组中，可将服务器选项作为参量指定给用于初始化服务器的mysql_server_init()。也能在诸如my.cnf的选项文件中给定它们。要想为C程序指定选项文件，请使用“--defaults-file”选项作为函数mysql_server_init()的第2个参量的元素之一。关于mysql_server_init()函数的更多信息，请参见25.2.12.1节，“mysql_server_init()”。
使用选项文件，能够简化客户端／服务器应用程序和嵌入了MySQL的应用程序之间的切换。将常用选项置于[server]组。它们可被两种MySQL版本读取。客户端／服务器选项应被放在[mysqld]部分。将嵌入式MySQL服务器库的选项放在[embedded]部分。将与应用程序相关的选项放在标记为[ApplicationName_SERVER]的部分。请参见4.3.2节，“使用选项文件”。